1021 genlik yeni nəsil genomik panel: xərçəngdə fərdiləşdirilmiş müalicəyə güclü addım

Genetik testlər onkologiyanı dəyişdirdi

Bu gün artıq bilirik ki, hər xərçəng genetik baxımdan unikaldır. Buna görə fərdiləşdirilmiş təbabətin ən güclü vasitələrindən biri şişlərin genetik xəritəsini hazırlamaqdır. Həm toxuma nümunələri, həm də maye biopsiya ilə alınan nümunələrdə aparılan geniş əhatəli genetik təhlillərxəstə üçün ən uyğun müalicəni müəyyənləşdirməyə imkan verir.

Beynəlxalq tədqiqatçılarla birlikdə apardığımız və mənim də müəllifləri arasında olduğum bu tədqiqatda 1021 geni əhatə edən geniş yeni nəsil sekvensləmə (NGS) panelinin həm texniki dəqiqliyini, həm də klinik istifadə dəyərini qiymətləndirdik. Tədqiqat 20 iyun 2025-ci ildə International Journal of Molecular Sciences jurnalında dərc olundu və onkologiyada genetik testlərin yaratdığı imkanları bir daha göstərdi.

Tədqiqatın xülasəsi: 1300-dən çox şiş nümunəsində sınaqdan keçirildi

Yuxarıdakı qrafik1021 genlik NGS paneli ilə təhlil olunan 1300-dən çox xərçəng xəstəsində müşahidə edilən xərçəng növlərinin paylanmasını göstərir.

Tədqiqat çərçivəsində

• ümumilikdə 1368 xəstə nümunəsi araşdırıldı; 1345 nümunədə (%98,3) uğurlu NGS təhlili aparıldı.

• Ümumilikdə 10.805 genetik dəyişiklik aşkar edildi; bunların %66-sı "onkogen" və ya "ehtimalən onkogen" kimi təsnif edildi.

• Xəstələrin %50-dən çoxunda müalicə ilə hədəflənə bilən (on-label və ya off-label) genetik dəyişikliklər tapıldı.

• TMB (şişin mutasiya yükü) və MSI (mikrosatellit qeyri-sabitliyi) kimi immunoterapiya ilə əlaqəli biomarkerlərin aşkarlanması qızıl standart üsullarla yüksək uyğunluq göstərdi.

Əsas nəticələr: klinik əhəmiyyət baxımından güclü performans

Yuxarıdakı qrafik1021 genlik NGS paneli ilə təhlil olunan şiş nümunələrində əldə edilən klinik tətbiq imkanı (clinical actionability) nəticələrini göstərir.

• %12,6 xəstədə təsdiqlənmiş göstəriş üzrə (on-label) hədəfə yönəlmiş müalicə imkanı tapıldı.

• %43,9 xəstədə onkoloji təlimatdakı göstərişlərdən kənar (off-label) müalicəyə uyğun mutasiyalar aşkar edildi.

• %26,2 xəstə isə klinik tədqiqatlara uyğun genetik dəyişikliklər daşıyırdı.

• Digər kateqoriyalara müalicəyə davamlılıq mutasiyaları (%5,9), qeyri-müəyyən variantlar (VUS, %2,5), normal gen quruluşu (wild-type, %3,3) və tətbiq imkanı bilinməyən mutasiyalar (%5,6) daxildir.

1. Hədəflənə bilən mutasiyalar:

• Xəstələrin %12,6-sında təsdiqlənmiş göstəriş üzrə (on-label) hədəfə yönəlmiş müalicələrə uyğun genetik dəyişikliklər var idi.

• İmmunoterapiyaya uyğun biomarkerlər (məsələn, TMB>10 mut/Mb, MSI-H) daxil edildikdə bu göstərici %20,15-ə yüksəldi.

• Ən çox hədəflənən genlər: TP53 (%47,6), KRAS (%26,2), PIK3CA (%12,8), BRCA1/2 (%8,3), ERBB2 (%14,8)

2. Toxuma və maye biopsiyanın uyğunluq təhlili:

• 10 xəstədə həm FFPE (toxuma), həm də plazma (maye biopsiya) təhlilləri müqayisə edildi.

• %70 uyğunluq əldə olundu. Uyğun gəlməyən 3 halda plazma nümunələrində ctDNA aşkar edilməməsi xəstələrin müalicə alması ilə əlaqələndirildi.

3. HRR və PARP inhibitorları üçün proqnozlaşdırma:

• 1345 xəstənin %19,8-ində HRR siqnal yolları ilə əlaqəli mutasiyalar tapıldı.

• Xüsusilə BRCA1/2 (%3,7), ATM kimi genlərdəki variantlar bəzi xəstələri PARP inhibitorları kimi xüsusi müalicələrə namizəd edir.

4. İmmunoterapiya biomarkerləri:

• MSI-H: yalnız %1,2 xəstədə aşkar edildi (əksəriyyəti kolorektal xərçəng).

• TMB >10 mut/Mb: %9,2 xəstədə müşahidə edildi (xüsusilə ağciyər, süd vəzi, kolorektal şişlər).

Texniki etibarlılıq: klinik tətbiqə hazırdır

• SNV, indel, CNV və füzyonları %100-ə yaxın dəqiqliklə aşkarladı.

• VAF (variant allel tezliyi) %0,5 kimi aşağı göstəricilərdə belə yüksək həssaslıq göstərdi.

• Digər üsullarla müqayisədə %90-dan yüksək uyğunluq əldə etdi (xüsusilə HER2, ALK, TMB, MSI üçün).

Hibrid üsulun üstünlüyü: maye biopsiya ilə real vaxtda izləmə

• Panel amplikon əsaslı testlərə nisbətən daha geniş genomik sahələri əhatə edir.

• Hibrid tutma texnologiyasıaşağı ctDNA səviyyələrində belə həssas aşkarlama təmin edir.

• Bunun sayəsində xəstəliyin gedişini, müalicəyə cavabı və ya davamlılıq mutasiyalarını plazma vasitəsilə izləmək mümkün olur.

Klinik praktikada bu nə deməkdir?

Bu panel şiş biologiyasının ən incə detallarına çataraq həm toxuma, həm də maye nümunələrdən etibarlı və əhatəli genetik məlumat verə bilir. Beləliklə:

• Müalicə seçiminə birbaşa təsir edən mutasiyaların aşkarlanması təmin olunur.

• Şiş biologiyasına əsaslanan müalicə planlaşdırılması mümkün olur.

• Müalicəyə davamlılığın inkişafını və ya xəstəliyin təkrarlanmasını erkən aşkarlamaq potensialı artır.

Nəticə: fərdiləşdirilmiş təbabətin güclü vasitəsi

Bu tədqiqat 1021 genlik NGS panelinin həm texniki dəqiqlik, həm də klinik əhəmiyyət baxımından güclü vasitə olduğunu göstərir. Xüsusilə nadir mutasiyaları aşkarlamaq qabiliyyəti, toxuma əldə edilə bilmədikdə maye biopsiya ilə təhlil aparmaq imkanı və geniş əhatəsi sayəsində bu panelin xərçəng müalicəsində fərdiləşdirilmiş yanaşmanı daha yüksək səviyyəyə daşıya biləcəyi düşünülür.