Homoloji rekombinasiya çatışmazlığı nədir? Necə test edilir və xərçəngdə əhəmiyyəti

Homoloji rekombinasiya çatışmazlığı (HRD= Homologous Recombination Deficiency) hüceyrənin homoloji rekombinasiya yolu ilə DNT zədələnməsini təmir edə bilməməsi deməkdir. HRD nəticəsində hüceyrədə genomik qeyri-sabitlik yaranır və bu vəziyyət müxtəlif xərçənglərdə təhrikedici rol oynayır.

Homoloji rekombinasiya nədir?

Homoloji rekombinasiya DNT-də qırılma və təmir proseslərində istifadə olunan hüceyrə yoludur. Bu yol hüceyrələrin genetik məlumatının düzgün qorunmasını təmin edir. Homoloji rekombinasiya zamanı hüceyrənin bir-birinə bənzər nüsxələri olan homoloji xromosomlar arasında rekombinasiya baş verir. Nəticədə hüceyrələrdə genetik material mübadiləsi və ya təmir aparılır. Bu yol genetik xəstəliklərin yaranmasının qarşısını ala və hüceyrələrin normal çoxalma proseslərində mühüm rol oynaya bilər.

Homoloji rekombinasiya DNT rekombinasiyasının növlərindən biridir.

DNT rekombinasiyası hüceyrə daxilində DNT-nin yenidən təşkil edilməsi və ya dəyişdirilməsi kimi müəyyən olunur. Bu proses hüceyrənin genetik materialını yenidən qurmaq və ya düzəltmək üçün istifadə edilir.

Bir neçə fərqli növü var:

1. Homoloji rekombinasiya: iki homoloji xromosom arasındakı uyğun DNT sahələrinin dəyişdirilməsi üçün istifadə olunan hüceyrə yoludur. Bu proses hüceyrənin genetik materialını yenidən təşkil etmək və ya düzəltmək üçün istifadə edilir.

2. Sahəyə yönəldilmiş rekombinasiya: müəyyən geni və ya DNT sahəsini konkret yerdə dəyişdirmək üçün istifadə olunan hüceyrə yoludur. Bu proses gen mühəndisliyi və ya gen müalicəsi məqsədilə tətbiq olunur.

3. Qeyri-homoloji rekombinasiya: iki fərqli DNT sahəsini qarışdırmaq üçün istifadə olunan hüceyrə yoludur. Bu proses hüceyrənin genetik materialını dəyişdirir və genetik xəstəliklərə səbəb ola bilər.

Homoloji rekombinasiya çatışmazlığı nədir? Hansı xərçənglər üçün vacibdir?

Homoloji rekombinasiya çatışmazlığı (HRD) hüceyrələrin normal yerinə yetirdiyi homoloji rekombinasiya prosesinin pozulmasıdır. Bu halda hüceyrələrin genetik materialında xətalar yaranır və bu DNT xətaları toplandıqda hüceyrələrin normal çoxalmasını və ya ölümünü tətikləyə bilər. HRD xüsusilə yumurtalıq və süd vəzi xərçəngində vacibdir. Çünki bu xərçənglər üçün BRCA1 və BRCA2 genlərindəki mutasiyalar mühüm təhrikedici amillərdir və bu genlər homoloji rekombinasiya üçün lazımdır. Buna görə BRCA1 və BRCA2 genlərində irsi və/və ya somatik mutasiyaları olan şəxslərdə HRD yaranır və süd vəzi və yumurtalıq xərçəngi kimi irsi ola bilən xərçənglərin riski artır. HRD digər şiş növlərində də rol oynaya bilər. Məsələn, endometrial (uşaqlıq), prostat və mədəaltı vəzi xərçənglərində də HRD statusu vacibdir.

Xərçəngdə HRD statusunun aşkarlanması niyə vacibdir?

HRD testi yumurtalıq və üçlü mənfi süd vəzi xərçəngi olan bütün xəstələrdə PARP inhibitorları adlanan yeni nəsil xərçəng dərmanlarının istifadəsinin uyğunluğunu müəyyən etmək üçün tövsiyə edilir.

PARP inhibitorları DNT təmiri pozulduqda təsirli olan dərmanlardır; DNT təmiri pozuntusuna ən çox səbəb olan hüceyrə prosesləri BRCA1 və BRCA2 genlərində yarana bilən mutasiyalardır.

Yumurtalıq xərçəngi xəstələrinin təxminən 50%-sinin, üçlü mənfi süd vəzi xərçəngi xəstələrinin isə 35-40%-ının PARP inhibitorlarından faydalana biləcəyi çoxsaylı klinik tədqiqatlarla sübut olunub.

2014-dən bəri dörd PARP inhibitoru (PARPi) FDA tərəfindən təsdiqlənib: olaparib, niraparib, rucaparib və talazoparib. PARP inhibitorları 4 xərçəng növü üçün təsdiqlənib: yumurtalıq, prostat, mədəaltı vəzi və süd vəzi xərçəngi.

HRD necə test edilir?

Homoloji rekombinasiya çatışmazlığı (HRD) müxtəlif testlərlə aşkarlana bilər.

1. RediScore® şişin genomik qeyri-sabitliyinin analizi vasitəsilə HRD-nin mövcudluğunu proqnozlaşdırmaq üçün hazırlanmış genetik testdir. Homoloji rekombinasiya çatışmazlığı nəticəsində yaranan anormal xromosom strukturlarının analizi üçün standart üsul olan SNP (tək nukleotid polimorfizmləri) texnologiyasına əsaslanır. Şişdəki BRCA1 / 2 genlərinin mutasiya analizi ilə birləşdirildikdə HR yolunun funksionallığı barədə hərtərəfli məlumat verir.
   

   RediScore® testində HRD-nin hesablanması üçün üç bioloji parametrdən istifadə olunur (bunlar "genomik çapıqlar" da adlanır):
   » LOH - Heteroziqotluğun itirilməsi (Loss of Heterozygosity) 
   » TAI - Telomerik allel disbalansı
   » LST - Böyükmiqyaslı keçidlər

2. DNT həssaslığı testləri: bu testlər hüceyrələrin DNT həssaslığını ölçür. HRD olan hüceyrələrdə DNT həssaslığı artır. Buna görə HRD yarandıqda DNT həssaslığı testləri müsbət nəticə verir.

3. Replikasiyanı məhdudlaşdıran fermentli genomik analiz (REGA): REGA hüceyrə genomunda rekombinasiya proseslərini təhlil etmək üçün istifadə olunan texnikadır. HRD olan hüceyrələrdə REGA nəticələri anormaldır.

4. İmmunohistokimyəvi (IHK) analiz: bu testlər hüceyrələrdə BRCA1 və ya BRCA2 zülallarının mövcudluğunu və ya yoxluğunu müəyyən edir. HRD olan hüceyrələrdə BRCA1 və ya BRCA2 zülalları çatışmaya bilər.

5. Flüorometrik in situ hibridləşmə (FISH): FISH testləri hüceyrələrdə BRCA1 və ya BRCA2 genlərinin nüsxə sayını müəyyən edir. HRD olan hüceyrələrdə BRCA1 və ya BRCA2 genlərinin nüsxə sayı az ola bilər.