Ce este secvențierea de nouă generație (Next-Generation Sequencing, NGS)? Utilizarea în oncologie
În acest articol
Ce este secvențierea de nouă generație (NGS)? Utilizarea în oncologie
Secvențierea de nouă generație (next-generation sequencing, NGS) este o tehnologie de analiză genetică ce împarte ADN-ul în milioane de fragmente mici și le citește pe toate simultan . Astfel, printr-un singur test poate fi determinată în câteva zile secvența a sute de gene sau chiar a întregului genom. În oncologie, NGS dezvăluie „identitatea genetică” a tumorii, arătând ce medicament țintit ori imunoterapie ar putea funcționa, identifică predispoziția ereditară la cancer și permite urmărirea ADN-ului tumoral din sânge, adică biopsia lichidă. Explicăm aici funcționarea NGS, tipurile sale, utilizările în tratamentul cancerului, limitele și situația din Turcia.
- Ce face? Fragmentează ADN-ul sau ARN-ul, citește în paralel milioane de fragmente și găsește modificările comparându-le pe calculator cu genomul uman de referință.
- De ce contează? În timp ce metodele vechi examinau genele individual, NGS examinează zeci până la sute de gene într-un singur test și folosește eficient cantitatea redusă de țesut.
- Principalele utilizări oncologice: Alegerea tratamentului țintit, terapii independente de tumoră precum NTRK, MSI-H și TMB-H, teste pentru cancer ereditar și biopsia lichidă.
- Ghiduri: Societatea Europeană de Oncologie Medicală (ESMO) recomandă NGS în cancerele avansate pulmonare fără celule mici, prostatice, ovariene și biliare; actualizarea din 2024 a adăugat cancerul de sân și unele tumori rare.
- Așteptare realistă: Aproximativ o treime dintre pacienți prezintă o modificare relevantă terapeutic, dar proporția celor care primesc tratamentul corespunzător este mai mică.
- Turcia: Panelurile NGS din țesut și sânge se află pe lista de rambursare SGK (SUT), în funcție de numărul genelor.
Cancerul se dezvoltă prin acumularea în timp a modificărilor, mutațiilor, în ADN-ul celulelor. Două cancere ale aceluiași organ pot avea modificări foarte diferite. De exemplu, dintre doi pacienți cu cancer pulmonar, tumora unuia poate avea o mutație EGFR , iar a celuilalt o fuziune ALK , iar tratamentele lor cele mai eficiente sunt complet diferite. De ce contează poziția mutațiilor în tumoră și genele în care se află am explicat în articolul mutațiile canceroase .
Caracteristica NGS care a schimbat oncologia este că, în locul căutării individuale a modificărilor, le poate examina pe toate simultan. În trecut, în cancerul pulmonar se testa mai întâi EGFR, apoi ALK, apoi ROS1 , consumând țesut separat pentru fiecare test. Astăzi, un singur panel NGS poate examina împreună toate aceste gene, chiar sute.
Imaginați-vă genomul uman ca pe o carte uriașă, cu aproximativ 3,1 miliarde de litere . Metoda veche, secvențierea Sanger, seamănă cu citirea unei anumite pagini rând cu rând: corectă, dar lentă. NGS taie multe copii ale cărții în milioane de fâșii mici, le citește simultan și găsește greșelile de scriere comparându-le pe calculator cu o „carte de referință” standard. Același rând este citit de zeci sau sute de ori, astfel că o singură eroare de citire nu induce în eroare și pot fi identificate chiar modificări prezente numai în puține celule.
Concepte fundamentale: genă, genom, exom
- ADN-ul și bazele: ADN-ul constă în succesiunea a patru elemente de construcție, nucleotide. Le denumim prin inițialele bazelor purtate: A (adenină), T (timină), G (guanină), C (citozină). „Secvențierea” înseamnă citirea ordinii acestor litere. Povestea descoperirii structurii de dublu helix a ADN-ului se află în articolul dublul helix al ADN-ului , unde am relatat-o.
- Cromozom: În celulele umane există 23 de perechi, în total 46 de cromozomi: 22 de perechi de autozomi și o pereche de cromozomi sexuali.
- Genom: Întreaga secvență de ADN a unei celule. La om, aproximativ 3,1 miliarde de perechi de baze.
- Genă: Regiune de ADN cu o anumită funcție. Conform bazelor de date actuale, omul are aproximativ 19.900 de gene care codifică proteine ; cifra de 25.000 frecvent citată anterior nu este actuală. În plus există zeci de mii de gene ARN care nu se transformă în proteine.
- Exom: Totalitatea regiunilor genelor care codifică proteine, exonii. Reprezintă numai aproximativ %1,5 din genom, dar aici se află o parte importantă a modificărilor cunoscute că provoacă boli.
- Modificare somatică și germinală (ereditară): Modificarea somatică există numai în celulele tumorale și nu este moștenită. Modificarea germinală există de la naștere în toate celulele și se poate transmite familial. NGS le poate identifica pe ambele; proba examinată, tumoră sau sânge, este determinantă pentru distincție.
Context istoric: premierele secvențierii din 1977 până astăzi
Povestea Proiectului Genomului Uman și impactul său asupra cancerului au fost explicate în detaliu în articolul Proiectul Genomului Uman . Esența istoriei este următoarea: primul genom uman a necesitat 13 ani și miliarde de dolari, iar astăzi sute de gene din tumora unui pacient pot fi examinate în câteva zile, cu cost mult mai mic.
Cum se efectuează NGS?
NGS se deosebește de metodele anterioare prin desfășurarea reacțiilor de secvențiere în paralel : milioane de fragmente ADN sunt citite simultan. Deoarece fragmentelor fiecărei probe li se adaugă o secvență scurtă de „cod de bare”, probele multor pacienți pot fi citite împreună în aceeași analiză, iar calculatorul atribuie fiecare citire pacientului corect. Astfel scade costul per probă.
Figura 1 · NGS de la probă la raport
Etapele de laborator și cele de calculator, bioinformatice, determină împreună rezultatul.
În tehnologia cea mai răspândită, Illumina, citirea se bazează pe „secvențiere prin sinteză”: la construirea unei catene noi în fața fragmentului monocatenar, baza adăugată la fiecare pas poartă un marcaj luminos diferit, înregistrat de cameră. Altă tehnologie, Ion Torrent, măsoară în locul luminii mica schimbare de pH produsă la adăugarea fiecărei baze. Tehnologiile de citire lungă , PacBio și Oxford Nanopore, răspândite în ultimii ani, pot rezolva regiuni complexe citind fragmente ADN mult mai lungi dintr-o dată; primul genom uman complet fără lacune a fost încheiat cu acestea în 2022.
Adâncimea: de ce citim aceeași regiune de sute de ori?
Numărul citirilor unei regiuni prin NGS se numește adâncime de citire sau acoperire. Adâncimea determină fiabilitatea rezultatului. Pentru căutarea modificărilor ereditare se recomandă 30-50 de citiri per regiune la secvențierea întregului genom și aproximativ 100 la secvențierea întregului exom. Testele tumorale necesită mult mai mult, deoarece proba este amestecată cu celule normale și o mutație poate exista numai în unele celule tumorale. De exemplu, FoundationOne CDx urmărește o mediană de peste 500 de citiri per regiune. În biopsia lichidă, cantitatea foarte mică de ADN tumoral din sânge cere adâncime și mai mare; eticheta FoundationOne Liquid CDx raportează o limită mediană de detectare în jurul valorii de %0,4 .
Figura 2 · Adâncimea de citire și frecvența alelică a variantei
Cu cât aceeași regiune este citită mai mult, cu atât cresc șansele detectării unei mutații prezente în puține celule.
Tipuri NGS: panel, exom, genom, ARN, biopsie lichidă
| Tip | Ce citește? | Adâncime tipică | Rolul în oncologie |
|---|---|---|---|
| Panel genic țintit | Zeci până la sute de gene selectate | Mare (mediană 500+) | Standardul practicii cotidiene; pentru alegerea tratamentului |
| Secvențierea întregului exom (WES) | Regiunile codificante ale tuturor genelor (%1,5 din genom) | Aproximativ 100 | Diagnosticul bolilor ereditare și cercetare |
| Secvențierea întregului genom (WGS) | Întregul genom | 30-50 (ereditar) | Cercetare; intră în utilizare clinică în unele centre |
| Secvențiere ARN | ARN-urile produse de gene | — | Gene de fuziune (ALK, ROS1, RET, NTRK, NRG1) și expresie genică |
| Biopsie lichidă (ctDNA) | ADN tumoral liber din sânge | Foarte mare | Dacă țesutul este insuficient, monitorizarea mutațiilor de rezistență, de exemplu ESR1, EGFR T790M, și boala reziduală în cercetare |
O eroare frecventă este afirmația „NGS nu analizează întregul genom, iar examinarea întregului exom este cea mai bună cale de screening al mutațiilor”. Și secvențierea întregului genom este o aplicație NGS. În practica oncologică însă, metoda cea mai frecventă nu este nici exomul, nici genomul, ci panelurile țintite, care citesc la adâncime foarte mare genele cunoscute drept importante în tumoră. Metoda „cea mai bună” depinde de întrebare.
Ce poate detecta NGS?
- Mutații punctiforme: Schimbarea unei singure baze, de exemplu EGFR L858R, KRAS G12C, BRAF V600E.
- Inserții și deleții mici: Adăugarea sau pierderea câtorva baze, de exemplu EGFR deleția exonului 19, HER2 inserțiile exonului 20.
- Modificări ale numărului de copii: Copierea excesivă a unei gene, amplificare, de exemplu MET, HER2, sau pierderea ei.
- Fuziuni: Unirea eronată a două gene, de exemplu ALK, ROS1, RET, NTRK, FGFR2. Unele pot scăpa panelului ADN, astfel că poate fi preferat un test bazat pe ARN.
- Semnături genomice: Instabilitatea microsateliților (MSI) și încărcătura mutațională tumorală (TMB). Sunt calculate din tiparul mutațional general al tumorii, nu dintr-o singură genă, și sunt folosite în decizia imunoterapiei.
Unde se folosește NGS în oncologie?
1. Alegerea tratamentului țintit
Cea mai importantă utilizare oncologică a NGS este identificarea modificărilor somatice tumorale pentru găsirea medicamentului țintit potrivit pacientului. Tabelul rezumă principalele modificări căutate prin NGS în boala avansată. Lista se extinde anual prin aprobări noi.
| Cancer | Principalele modificări căutate prin NGS |
|---|---|
| Pulmonar fără celule mici | EGFR, ALK, ROS1, BRAF V600E, KRAS G12C, MET exonul 14, RET, HER2 mutație, NTRK, NRG1 |
| Sân | PIK3CA, AKT1, PTEN, ESR1 (frecvent din sânge), ereditar BRCA1/2 |
| Colorectal | KRAS/NRAS, BRAF V600E, MSI, HER2 amplificare |
| Prostată | BRCA1/2 și alte gene de reparare ADN (HRR), MSI |
| Ovar | BRCA1/2, deficit de recombinare omoloagă (HRD) |
| Căi biliare (colangiocarcinom) | FGFR2 fuziune, IDH1, HER2, BRAF V600E, MSI |
| Tiroidă | RET, BRAF, NTRK |
Medicamentele dezvoltate pentru fiecare modificare au fost abordate în articole separate: ALK pentru alectinib, HER2 mutant în cancerul pulmonar pentru T-DXd, PIK3CA pentru inhibitorii PI3K, ESR1 pentru camizestrant și FGFR2 pentru lirafugratinib.
2. Tratamente independente de tumoră (independente de organ)
Unele medicamente au fost aprobate în toate tumorile cu un anumit biomarker, indiferent de organul de origine. Cea mai practică metodă de detectare a majorității acestor biomarkeri este NGS; de aceea, NGS cuprinzătoare capătă importanță specială în tumorile rare și la pacienții care au epuizat tratamentele standard.
| Biomarker | Medicament | Aprobare FDA |
|---|---|---|
| MSI-H / dMMR | Pembrolizumab | 23 mai 2017 (prima aprobare independentă de tumoră) |
| NTRK fuziune | Larotrectinib; entrectinib; repotrectinib | Noiembrie 2018; august 2019; iunie 2024 |
| TMB-H (≥10 mutații/megabază) | Pembrolizumab | 16 iunie 2020 (cu FoundationOne CDx) |
| BRAF V600E | Dabrafenib + trametinib | Iunie 2022 |
| RET fuziune | Selpercatinib | Septembrie 2022 |
| HER2 (IHC 3+)* | Trastuzumab deruxtecan | Aprilie 2024 |
*Excesul proteinei HER2 este determinat prin imunohistochimie (IHC), nu NGS; a fost adăugat în tabel pentru completare. Și dostarlimab este o opțiune aprobată în tumorile dMMR.
3. Identificarea predispoziției ereditare la cancer
Panelurile NGS din sânge sau salivă examinează într-un singur test gene ereditare de cancer precum BRCA1/2, genele sindromului Lynch (MLH1, MSH2, MSH6, PMS2), TP53, PALB2 . Informația influențează atât tratamentul pacientului, precum inhibitorii PARP, cât și screeningul membrilor familiei și măsurile preventive. Pentru detalii puteți consulta articolul operația preventivă la purtătorii BRCA .
Un aspect important: Și NGS din țesutul tumoral poate indica o modificare ereditară. O analiză Memorial Sloan Kettering cu aproximativ 12.000 de pacienți a identificat la %17 o modificare ereditară patogenă sau probabil patogenă, iar la %8 una cu posibilitate de acțiune clinică; mulți nu îndeplineau criteriile actuale de testare genetică. De aceea, dacă raportul tumoral conține o constatare posibil ereditară, trebuie confirmată prin sânge și oferită consiliere genetică.
4. Biopsia lichidă
Celulele tumorale eliberează în sânge fragmente mici de ADN, ADN tumoral circulant sau ctDNA. Examinarea lor prin NGS ajută alegerea tratamentului când țesutul nu poate fi obținut sau este insuficient și permite monitorizarea mutațiilor de rezistență apărute în timpul tratamentului, de exemplu în cancerul de sân ESR1. Utilizările pentru detectarea bolii microscopice rămase după operație, boala reziduală minimă, sunt încă predominant în cercetare. Studiul GALAXY pe acest subiect a fost abordat în articolul ctDNA și cancerul colorectal , iar testele sanguine pentru screeningul cancerului la persoane sănătoase în articolul Galleri .
Biopsia lichidă are două capcane importante: rezultatul negativ poate proveni din eliberarea insuficientă de ADN tumoral în sânge; de aceea nu exclude testarea țesutului. În plus, mutațiile acumulate odată cu vârsta în celulele sanguine, fără legătură cu cancerul,hematopoieza clonală, pot fi considerate eronat de origine tumorală.
5. Alte utilizări
- Farmacogenetică: Examinarea genelor care determină procesarea unor medicamente în organism. De exemplu, modificările genei DPYD cresc riscul reacțiilor adverse severe la chimioterapii precum 5-FU și capecitabina.
- Diagnostic și clasificare: Mai ales în sarcoame, tumori cerebrale și leucemii-limfoame, modificările moleculare au devenit parte a diagnosticului.
- Cancere cu origine necunoscută: Recomandările ESMO din 2024 indică NGS pentru acești pacienți.
- Medicină reproductivă: Diagnostic genetic înaintea transferului embrionar la cupluri purtătoare ale unei gene de cancer ereditar, adică diagnostic genetic preimplantațional.
Ce spun ghidurile?
În 2020, Grupul de lucru ESMO pentru Medicină de Precizie a recomandat NGS de rutină în formele avansate de cancer pulmonar fără celule mici nescuamos, cancer de prostată, ovarian și biliar ; în cancerul colorectal, NGS a fost acceptată ca alternativă la testarea genelor individuale. Actualizarea din 2024 a adăugat cancerul de sân avansat, unele cancere rare, tumora stromală gastrointestinală, sarcoamele țesuturilor moi și cancerul tiroidian, și cancerele cu origine necunoscută . Biomarkerii independenți de tumoră (NTRK, RET, BRAF V600E, MSI-H, TMB-H) contează indiferent de tipul tumorii. Și ghidurile NCCN din SUA recomandă „profilare moleculară largă” în multe cancere avansate.
Figura 3 · Cum se citește un raport NGS?
Nu toate modificările raportului au aceeași semnificație. Tipul constatării determină acțiunea.
Limite și așteptări realiste
NGS este un instrument puternic, dar nu înseamnă că va găsi o „țintă” fiecărui pacient. La primii 10.336 de pacienți examinați prin MSK-IMPACT la Memorial Sloan Kettering, aproximativ %37 dintre tumori aveau cel puțin o modificare relevantă terapeutic, însă numai aproximativ %11 dintre pacienți au putut fi îndrumați spre studii clinice pe baza lor. Există o imagine similară și în țara noastră: într-un studiu unicentric prezentat la Congresul Turc de Oncologie Medicală din 2026, dintre 91 de pacienți cu NGS somatică, %38 din constatări aveau dovezi de nivel înalt, ESCAT I-II, dar %15 dintre pacienți au putut primi tratament țintit.
- Proporția modificărilor relevante terapeutic variază mult după cancer. Este mare în adenocarcinomul pulmonar și mică în unele cancere. Așteptarea „se găsește un medicament pentru fiecare pacient” este nerealistă.
- Poate exista distanță între constatare și tratament. Medicamentul corespunzător modificării poate să nu fie autorizat sau rambursat în țara noastră, iar accesul la studii clinice poate fi limitat.
- Variantele cu semnificație incertă (VUS) sunt frecvente și pot crea îngrijorare; nu sunt folosite în decizii de tratament sau screening familial.
- Problema țesutului: Biopsiile mici și probele vechi ori prost păstrate pot determina eșecul testului. Este importantă planificarea la diagnostic a unui țesut suficient pentru NGS.
- Durata: Rezultatele pot necesita zile până la săptămâni. Când tratamentul trebuie început rapid, ordinea testelor trebuie planificată cu oncologul.
- Constatări ereditare: Testele tumorale pot dezvălui neașteptat constatări ereditare; sunt importante informarea prealabilă a pacientului și consilierea genetică.
- „Mai multe gene” nu înseamnă întotdeauna „mai bine”. Contează examinarea fiabilă a genelor necesare acelui cancer și interpretarea rezultatului de către o echipă experimentată.
Situația din Turcia
- Rambursare SGK: Lista punctajelor actualizată prin modificarea din 21 aprilie 2024 a Comunicatului de implementare în sănătate (SUT) include procedurile de secvențiere ADN de nouă generație în funcție de numărul genelor examinate , cu coduri separate: 1 genă, 2-4, 5-15, 16-40 și 41 sau mai multe gene. Există coduri distincte pentru paneluri NGS generale, analiza somatică a mutațiilor tumorale și paneluri somatice din ADN liber sanguin, biopsia lichidă. Textul nu enumeră cancere specifice; definește frecvența facturării și limite per genă.
- Condiția pentru biopsia lichidă: Panelurile somatice din sânge necesită un raport de comisie medicală care include cel puțin un specialist în genetică medicală și unul în oncologie medicală.
- Reglementare: Centrele de diagnostic genetic sunt supuse Regulamentului centrelor de evaluare a bolilor genetice din 2020; responsabilul centrului trebuie să fie specialist în genetică medicală sau pediatrică.
- Utilizarea se extinde: Într-un studiu din șapte centre, cu 1.023 de pacienți cu cancer pulmonar metastatic (2018-2025), %52 au efectuat NGS; utilizarea NGS în 2025 a depășit %90. La %28 dintre pacienți a fost găsită o modificare țintibilă (EGFR %16, ALK %5).
- Tarifele testelor private: Variază după instituție și test; nu am putut obține o informație fiabilă și actuală despre preț.
- Proiectul Genomului Turciei: Proiectul anunțat în 2019 de Ministerul Sănătății și TÜSEB urmărea secvențierea genomului a 100.000 de persoane în câțiva ani; nu am putut obține date verificate despre situația sa actuală.
Urmărim accesul la medicamentele țintite în țara noastră în articolul medicamente oncologice noi aprobate de FDA: harta accesului în Turcia .
Întrebări frecvente
- Testul NGS trebuie făcut fiecărui pacient cu cancer?
- Nu. Ghidurile recomandă NGS în special în cancerele avansate pulmonare, prostatice, ovariene, biliare și mamare, cancerele cu origine necunoscută și unele tumori rare. În multe cancere precoce, decizia terapeutică nu se bazează pe NGS. Oncologul decide necesitatea testului.
- Este necesară o biopsie nouă?
- De cele mai multe ori nu; poate fi folosit țesutul prelevat la diagnostic și păstrat în anatomopatologie, blocul de parafină. Dacă este insuficient, pot fi luate în considerare o biopsie nouă sau biopsia lichidă din sânge.
- În cât timp apare rezultatul?
- Variază după laborator și test; în general între câteva zile și câteva săptămâni.
- NGS tumorală și testarea genetică ereditară sunt același lucru?
- Nu. Testul tumoral caută modificările apărute ulterior în celulele tumorale. Testul ereditar se face din sânge ori salivă și caută modificările prezente de la naștere. Testul tumoral poate indica o modificare ereditară, dar aceasta trebuie confirmată prin sânge.
- Raportul meu spune „variantă cu semnificație incertă”. Trebuie să mă îngrijorez?
- În general nu. Înseamnă că nu se știe încă dacă modificarea este dăunătoare. Aceste variante nu sunt folosite în decizii terapeutice și, cu timpul, se constată că majoritatea sunt inofensive.
- Biopsia lichidă înlocuiește biopsia tisulară?
- Nu complet. Este foarte valoroasă când nu se poate obține țesut sau pentru monitorizarea mutațiilor de rezistență. Dacă însă tumora nu eliberează suficient ADN în sânge, rezultatul poate fi fals negativ; atunci este necesară testarea țesutului.
- Ce se întâmplă dacă NGS nu găsește o țintă?
- Nu înseamnă că nu aveți opțiuni terapeutice. Chimioterapia, imunoterapia și celelalte tratamente standard continuă să fie folosite; în evoluția bolii pot apărea și teste ori medicamente noi.
Glosar
- Secvențiere de nouă generație (NGS)
- Tehnologie care citește simultan milioane de fragmente ADN sau ARN. Se numește și secvențiere masiv paralelă.
- Secvențiere Sanger
- Metodă clasică dezvoltată în 1977, care citește ADN-ul în fragmente individuale.
- Adâncime de citire (acoperire)
- De câte ori este citită o regiune ADN. Fiabilitatea crește odată cu adâncimea.
- Frecvența alelică a variantei (VAF)
- Procentul citirilor unei regiuni în care există modificarea.
- Somatic / germinal
- Somatic: modificare numai în tumoră, nemoștenită. Germinal: modificare prezentă de la naștere în toate celulele și transmisibilă ereditar.
- Genă de fuziune
- Genă anormală formată prin unirea a două gene diferite; ținta multor terapii țintite.
- MSI / TMB
- Instabilitatea microsateliților și încărcătura mutațională tumorală; semnături genomice care arată nivelul mutațional general al tumorii și sunt asociate răspunsului la imunoterapie.
- ctDNA
- Fragmente de ADN liber de origine tumorală care circulă în sânge.
- Variantă cu semnificație incertă (VUS)
- Modificare genetică a cărei legătură cu boala nu este încă cunoscută.
- Test diagnostic companion
- Test aprobat împreună cu un anumit medicament pentru stabilirea pacienților care îl vor folosi.
Comentariul Academiei DROZDOGAN
În ultimii zece ani, NGS a adăugat în oncologie întrebarea „ce modificare genetică are?” lângă „al cărui organ este cancerul?”. Astăzi, în multe cancere, în special pulmonar avansat, alegerea tratamentului optim nu este posibilă fără NGS.
⚡ De ce contează
Examinând zeci până la sute de gene într-un singur test, folosește eficient țesutul, economisește timp și împiedică omiterea modificărilor rare, dar tratabile, precum fuziunileNTRK, RET, NRG1 . Aprobările independente de tumoră au făcut NGS indispensabilă și în tumorile rare.
✅ Puncte forte
Sensibilitate mare, analiza simultană a mutațiilor, fuziunilor, numărului de copii și semnăturilor genomice MSI și TMB; posibilitatea folosirii sângelui și identificării predispozițiilor ereditare. Rolul clinic este solid prin testele diagnostice companion aprobate FDA și recomandările ESMO. În Turcia este rambursată de SGK, iar utilizarea în cancerul pulmonar crește rapid.
⚠️ Limite
Numai o parte dintre pacienți prezintă modificări relevante terapeutic și doar o parte dintre aceștia ajung la medicamentul corespunzător. Rezultatele necesită interpretare experimentată; variantele incerte și constatările ereditare neașteptate pot crea confuzie. Calitatea țesutului, durata și costul sunt obstacole practice importante.
🩺 Ce trebuie făcut în practică
- Dacă ați fost diagnosticat cu cancer avansat, întrebați oncologul dacă NGS este necesară pentru dumneavoastră .
- La planificarea biopsiei, amintiți importanța prelevării de țesut suficient pentru testele moleculare .
- Evaluați obligatoriu raportul cu oncologul; dacă este posibil, cereți discutarea lui în comisia moleculară pentru tumori .
- Dacă raportul include o modificare posibil ereditară, solicitați consiliere genetică ; poate conta și pentru membrii familiei.
- Testele genetice „de cancer” vândute pe internet fără îndrumare medicală trebuie abordate cu prudență.
❓ Întrebări deschise
Va deveni secvențierea întregului genom un test tumoral de rutină? Vor schimba testele de boală reziduală din sânge deciziile terapeutice postoperatorii? Cât va accelera inteligența artificială interpretarea datelor NGS? Și, mai ales, cum va fi asigurat accesul la tratamente potrivite tuturor țintelor găsite?
Verdictul nostru pe scurt: Secvențierea de nouă generație este unul dintre instrumentele diagnostice fundamentale ale oncologiei moderne. Este un test standard recomandat de ghiduri în cancerele avansate pulmonare, prostatice, ovariene, biliare și mamare și în cele cu origine necunoscută. NGS nu este însă un „test miraculos”; valoarea depinde de pacientul și momentul corect și de transformarea rezultatului în tratament de o echipă experimentată.
- Acesta este articolul NGS anterior al site-ului, actualizat și extins. A fost pregătit pe baza surselor publice disponibile în septembrie 2026: Institutul Național american de Cercetare a Genomului Uman, Ensembl, Fundația Nobel, Illumina, FDA, CMS, documentația Foundation Medicine, comunicate ale companiilor, știri profesionale, comunicatul SGK, Monitorul Oficial și studii publicate din Turcia.
- Corecții ale versiunii anterioare: Omul nu are 23, ci 23 de perechi (46) de cromozomi; numărul genelor codificante nu este aproximativ 25.000, ci aproximativ 19.900; partea codificantă reprezintă circa %1,5 din genom; și înainte de 2010 erau folosite secvențierea Sanger (1977) și NGS comercială (după 2005); NGS poate citi întregul genom; testele tumorale realizează sute de citiri per regiune, nu 10-20.
- Informații preluate din surse secundare: Aria recomandărilor ESMO din 2024 a fost preluată dintr-un rezumat al unei companii deoarece articolul primar nu era accesibil; ratele modificărilor ereditare în tumori, %17 și %8, din știri ale unei reviste profesionale; unele date ale aprobărilor independente de tumoră, dintr-o sursă profesională de știri. Pentru istoria primelor platforme NGS comerciale a fost folosită o sursă enciclopedică.
- Informații SUT: Codurile și condițiile provin din rezumatul comunicatului din 21 aprilie 2024; pentru condițiile actuale de aplicare trebuie consultat textul SGK în vigoare. Tarifele testelor private și situația actuală a Proiectului Genomului Turciei nu au putut fi verificate.
- Elemente bazate pe cunoștințe generale: Tabelul modificărilor căutate după tipul cancerului, hematopoieza clonală, DPYD și farmacogenetica sa, avantajul testelor ARN în fuziuni și recomandările NCCN sunt prezentate ca informații oncologice consacrate.
- Secțiunea „Evaluarea noastră” și comentariul Academiei ne aparțin.
- Schemele provin din afirmațiile verificate ale textului și nu conțin date noi.
- Articolul nu reprezintă sfat medical personalizat. Deciziile privind testele genetice trebuie luate cu oncologul și, la nevoie, specialistul în genetică medicală.
Surse
- National Human Genome Research Institute. Fișa Proiectului Genomului Uman; costul secvențierii genomului uman; glosar genetic: exom, cromozom.
- NHGRI. Cercetătorii generează prima secvență completă, fără lacune, a unui genom uman. 31 martie 2022.
- Ensembl 116 (GENCODE 50, GRCh38.p14). Statistici ale adnotării genomului uman. Iunie 2026.
- Nobel Prize Outreach. Frederick Sanger, Premiul Nobel pentru Chimie 1980: date.
- Illumina. Introducere în secvențierea de nouă generație; tehnologia secvențierii; acoperirea secvențierii.
- Illumina. Lansarea seriei NovaSeq X. Comunicat, 29 septembrie 2022.
- Foundation Medicine. Etichetele cu informații tehnice FoundationOne CDx și FoundationOne Liquid CDx.
- FDA / Thermo Fisher. FDA aprobă primul test diagnostic companion care examinează simultan țintele mai multor terapii pentru cancerul pulmonar fără celule mici, Oncomine Dx Target Test. 22 iunie 2017.
- Memorial Sloan Kettering. FDA autorizează testul MSK-IMPACT pentru analiza tumorilor pacienților. 15 noiembrie 2017; NCI Cancer Currents: teste de profilare genomică.
- CMS. FDA anunță aprobarea, CMS propune acoperirea primului test cu desemnare revoluționară pentru detectarea unui număr mare de biomarkeri oncologici, FoundationOne CDx. 30 noiembrie 2017.
- Guardant Health. FDA aprobă primul test diagnostic companion NGS de biopsie lichidă. 7 august 2020.
- OncLive. FDA aprobă FoundationOne Liquid CDx pentru tumori solide. August 2020; aprobările independente de tumoră ale T-DXd și repotrectinibului duc domeniul înainte. 2024.
- FDA. FDA acordă aprobare accelerată pembrolizumabului pentru prima indicație independentă de țesut/localizare. 23 mai 2017.
- FDA. FDA aprobă larotrectinib pentru tumori solide cu fuziuni NTRK. 26 noiembrie 2018.
- FDA. FDA aprobă pembrolizumab pentru adulți și copii cu tumori solide TMB-H. 16 iunie 2020.
- Mosele MF și colaboratorii. Recomandări pentru utilizarea secvențierii de nouă generație (NGS) la pacienții cu cancer avansat în 2024: raport al Grupului de lucru ESMO pentru Medicină de Precizie. Ann Oncol. 2024 (prin rezumatul SOPHiA Genetics).
- CAP TODAY. Loc de dezvoltare: secvențiere tumorală-germinală (Stadler și colaboratorii, JCO 2021).
- Instituția de Securitate Socială. Comunicat de modificare a Comunicatului de implementare în sănătate, EK-2/B. Monitorul Oficial, 21 aprilie 2024, numărul 32524.
- Regulamentul centrelor de evaluare a bolilor genetice. Monitorul Oficial, 10 ianuarie 2020, numărul 31004.
- Karaoğlu și colaboratorii. Utilizarea NGS în cancerul pulmonar metastatic fără celule mici, date multicentrice din Turcia. Genes. 2025;16(12):1446.
- Yazkaç și colaboratorii. Rezultatele NGS somatice și accesul la tratamentul țintit. Comunicare la Congresul Turc de Oncologie Medicală 2026.
- Yeni Şafak. Este realizată harta genetică a populației turce, Proiectul Genomului Turciei. 5 noiembrie 2019.
Surse
Next-Generation Sequencing in Oncology: Genetic Diagnosis, Risk Prediction and Cancer Classification.
Int J Mol Sci, Feb 2017.
Ți-a fost util acest articol?
Feedbackul tău ne ajută să îmbunătățim conținutul.
Comentariile cititorilor
Împărtășește comentariul tău
Numele și comentariul dumneavoastră sunt publicate numai după aprobarea administratorului. Adresa de e-mail nu este afișată niciodată vizitatorilor.
Fii primul care comentează.