Ce este noua variantă-mutație a coronavirusului? Cum a fost descoperită? Vor fi eficiente vaccinurile?

În acest articol
Consorțiul de Genetică Covid-19 din Regatul Unit analiza modificările genetice ale coronavirusului din aprilie 2020, studiind 140 mii de genomuri SARS-CoV-2 virale prin secvențiere. La 18 decembrie 2020, consorțiul a anunțat descoperirea unei noi variante a virusului, cu trăsături genetice și comportamentale noi. Această nouă variantă a SARS-CoV-2 a primit numele „VUI-202012/01” sau „B.1.1.7”. Să răspundem întrebărilor despre această variantă în lumina progreselor științifice de până acum.
Ce este noul SARS-CoV-2? Ce știm despre el?
Noua variantă descoperită în Regatul Unit a fost numită „VUI-202012/01” sau „B.1.1.7”. A devenit importantă deoarece, spre deosebire de variantele anterioare, au fost identificate numeroase mutații (modificări genetice).
B.1.1.7 are 17 mutații. Acestea au apărut în diferite regiuni ale virusului.
Mutațiile nou descrise ale coronavirusului sunt:
- În regiunea ORF1ab: T1001I, A1708D, I2230T, SGF 3675-3677 (deleție / ștergere)
- În regiunea Spike (coroană / spin): deleție 69-70, deleție Y144, N501Y, A570D, P681H, T716I, S982A și D1118H
- În regiunea N: Q27stop, R52I și Y73C în ÖRF8; D3L și S235F
Dintre acestea, cele mai importante mutații sunt cele din proteinele spike: N501Y, N439K, Y453F și 69-70del.
De ce este mai contagioasă noua variantă a coronavirusului?
Mutația N501Y a apărut în domeniul de legare de receptor al proteinei spike a virusului. Virusul folosește această regiune pentru a se lega, pe celulele umane, de receptorul ACE2. Această mutație poate crește legarea virusului de receptorul ACE2.
Celelalte două mutații, N439K și Y453, au apărut tot în domeniul de legare de receptor. S-a observat că aceste mutații cresc legarea de receptorii ACE2 și facilitează evadarea de sub controlul sistemului imunitar al organismului.
Mutația P681H a apărut la situsul de clivaj al furinei din proteina spike. Încă nu îi cunoaștem efectul biologic.
Mutația de deleție 69-70 s-a format prin ștergerea aminoacizilor 69 și 70 din proteina spike. Se consideră că facilitează evadarea virusului de sub controlul sistemului imunitar. Se sugerează că mutația a apărut la un pacient cu Covid-19 cronică tratat cu plasmă convalescentă (de la persoane vindecate). Virusul s-ar fi putut modifica la acest pacient pentru a evita tratamentul cu anticorpi.
În laborator s-a arătat anterior că aceste mutații permit virusului să infecteze mai ușor celule și șoareci. Totuși, încă nu avem dovezi științifice directe că este mai contagios la oameni.
Când a fost descoperită noua variantă?
Toate virusurile suferă mutații în timp și apar variante noi. Acest lucru este de așteptat.
Analizele genetice arată că noua variantă a SARS-CoV-2 a apărut în septembrie 2020 și a circulat la niveluri scăzute în comunitate până la mijlocul lui noiembrie.
Descoperirea variantei se bazează pe investigarea de către centrul de sănătate publică englez a motivelor pentru care cazurile din orașul „Kent” nu scădeau în ciuda măsurilor stricte.
Ulterior s-a observat răspândirea rapidă a variantei în Londra și Essex. Distribuția sa în alte țări nu este încă cunoscută, deoarece acestea nu au efectuat analize detaliate ale genomului viral. Totuși, în Italia a fost identificată noua variantă la o persoană venită din Regatul Unit.
Vor fi eficiente vaccinurile împotriva noului coronavirus?
Nu avem dovezi științifice în acest sens. Dacă noua variantă afectează vaccinurile se va stabili după cercetări de laborator.
Cele 3 vaccinuri moderne dezvoltate (BioNTech, Moderna și AstraZeneca) țintesc proteinele spike ale virusului. Noua variantă are mutații în regiunea proteinei spike. Vaccinurile determină producția anticorpilor împotriva mai multor regiuni ale proteinei spike. De aceea, probabilitatea ca noua variantă să reducă eficacitatea vaccinurilor este foarte mică. Vaccinurile asigură imunitatea prin anticorpi multipli.
Este de așteptat apariția mutațiilor în SARS-CoV-2?
SARS- CoV-2 este un virus ARN. Pe măsură ce virusul se multiplică, apariția mutațiilor este un proces natural. De la începutul epidemiei, în SARS-CoV-2 au fost observate mii de mutații. Marea majoritate nu au niciun efect. De exemplu, până acum au fost identificate peste 4000 de mutații în proteina spike a SARS-CoV-2.
Măsurile de carantină și interdicțiile de zbor adoptate de țări sunt firești. Ele trebuie luate până când sunt înțelese caracteristicile noii variante.
*
*
SUBIECTE ASOCIATE
Surse
2. COVID-19 Genomics UK (COG-UK) consortiumcontact@cogconsortium.uk. 2020. An Integrated National Scale SARS-CoV-2 Genomic Surveillance Network. The Lancet. Microbe 1 (3): e99–100. Bal A, Destras G, Gaymard A, Regue H, Semanas Q, d’Aubarde C, Billaud G, Laurent F, Gonzales C, Valette
3. M, Lina B, Morfin F, Josset L. Screening of the H69 and V70 deletions in the SARS-CoV-2 spike protein with a RT-PCR diagnosis assay reveals low prevalence in Lyon, France. medRxiv 2020, 2020.11.10.20228528.
4. Kemp, Steven A., Dami A. Collier, Rawlings Datir, Salma Gayed, Aminu Jahun, Myra Hosmillo, Isabella Atm Ferreira, et al. 2020. Neutralising Antibodies Drive Spike Mediated SARS-CoV-2 Evasion. medRxiv.
5. Andrew Rambaut, Edward C. Holmes, Áine O’Toole, Verity Hill, John T. McCrone, Christopher Ruis, Louis du Plessis, and Oliver G. Pybus. 2020. A Dynamic Nomenclature Proposal for SARS-CoV-2 Lineages to Assist. Genomic Epidemiology. Nature Microbiology 5 (11): 1403–7.
6. Thomson EC, Rosen LE, Shepherd JG, Spreafico R. 2020. The Circulating SARS-CoV-2 Spike Varyant N439K Maintains Fitness While Evading Antibody-Mediated Immunity. bioRxiv.
7. Erik Volz, Verity Hill, John T. McCrone, Anna Price, David Jorgensen, Áine O’Toole, Joel Southgate, et al. 2020. “Evaluating the Effects of SARS-CoV-2 Spike Mutation D614G on Transmissibility and Pathogenicity.” Cell, November.
8. NERVTAG: Risk assessment of SARS-CoV-2 varyants that have been selected in mink, 12 November 2020. Paper prepared by the New and Emerging Respiratory Virus Threats Advisory Group (NERVTAG).
9. Preliminary genomic characterisation of an emergent SARS-CoV-2 lineage in the UK defined by a novel set of spike mutations, Andrew Rambaut, Nick Loman, Oliver Pybus, Wendy Barclay, Jeff Barrett, Alesandro Carabelli, Tom Connor, Tom Peacock, David L Robertson, Erik Volz, on behalf of COVID-19 Genomics Consortium UK (COG-UK). https://virological.org/t/563
Ți-a fost util acest articol?
Feedbackul tău ne ajută să îmbunătățim conținutul.





Comentariile cititorilor
Împărtășește comentariul tău
Numele și comentariul dumneavoastră sunt publicate numai după aprobarea administratorului. Adresa de e-mail nu este afișată niciodată vizitatorilor.
Fii primul care comentează.