Redaktə etdiyim Genes jurnalında xüsusi buraxılış: Xərçəng Hüceyrəsinin Plastikliyi və Müalicə Müqaviməti

Xərçəng hüceyrələri müalicədən necə yayınır?

Beynəlxalq resenziyalı elmi jurnal Genes (MDPI) xərçəng hüceyrələrinin müalicə təzyiqi altında kimliyini dəyişərək necə sağ qaldığını və dərmanlara qarşı necə davamlılıq qazandığını araşdıran xüsusi say başladıb: "Genomic and Epigenomic Drivers of Cancer Cell Plasticity and Therapy Resistance" (Xərçəng hüceyrəsinin plastikliyinin və müalicəyə davamlılığın genomik və epigenomik determinantları). Genetik mühəndis Dr. Muharrem Okan Çakır ilə birlikdə bu xüsusi sayın qonaq redaktorluğunu öz üzərimizə götürürük. Məqalələrin göndərilməsi 5 avqust 2027-ci il tarixinədək açıqdır. Bu yazıda xüsusi sayın mövzusunu, bunun mənim üçün niyə vacib olduğunu və tədqiqatçıların necə töhfə verə biləcəyini izah edirəm. Xərçəngin əsas biologiyası ilə xərçəng biologiyası yazımızda tanış ola bilərsiniz.

Bu mövzu niyə vacibdir?

Ağıllı dərmanlar və immunoterapiyalar bir çox xərçəng növündə müalicənin simasını dəyişdi. Lakin klinikada hər gün gördüyüm kimi, bu müalicələrin ən böyük məhdudiyyəti hələ də eynidir: başlanğıcda yaxşı cavab verən şişlərin əhəmiyyətli hissəsi bir müddət sonra dərmana baxmayaraq yenidən böyüməyə başlayır. Uzun illər bu davamlılığın əsasən yeni mutasiyalar, yəni DNA-dakı daimi dəyişikliklər hesabına inkişaf etdiyi düşünülürdü (xərçəng hüceyrələri müalicəyə qarşı necə davamlılıq qazanır?).

Son illərin tədqiqatları mənzərəni genişləndirdi. Xərçəng hüceyrələrinin bir hissəsi DNA ardıcıllığı dəyişmədən, hansı genlərin açıq və ya bağlı qalacağını müəyyən edən epigenetik tənzimləmələrini dəyişərək dərmandan yayına bilir. Bəziləri müvəqqəti olaraq "yuxu" bənzəri vəziyyətə keçir və müalicə bitdikdən sonra yenidən çoxalır; bəziləri isə tamamilə fərqli hüceyrə kimliyinə bürünür. Məsələn, EGFR mutasiyalı ağciyər xərçəngində müalicə zamanı şişin bir hissəsinin xırda hüceyrəli ağciyər xərçənginə çevrilə bildiyi məlumdur; mədəaltı vəz xərçəngində RAS inhibitorlarına qarşı yaranan davamlılıq da oxşar uyğunlaşma mexanizmlərini əhatə edir (EGFR mutasiyalı ağciyər xərçəngi, RAS inhibitoruna davamlılıq).

Bu uyğunlaşma qabiliyyətinə hüceyrə plastikliyi deyilir. Plastikliyi anlamaq davamlılığı yaranmazdan əvvəl proqnozlaşdırmağın və onun qarşısını alacaq müalicə kombinasiyaları hazırlamağın açarlarından biridir. Dr. Çakır ilə birlikdə bu xüsusi sayı məhz bu sual ətrafında qurduq.

Xərçəng hüceyrəsinin plastikliyi nədir?

Xərçəng hüceyrəsinin plastikliyi şiş hüceyrələrinin müalicə və ya mühit təzyiqi altında gen ifadəsi proqramlarını və hüceyrə kimliyini dəyişə bilmə qabiliyyətidir. Bu dəyişiklik çox vaxt DNA ardıcıllığında daimi mutasiya olmadan, epigenetik tənzimləmələr vasitəsilə baş verir. Nəticədə dərmana müvəqqəti dözümlülük, fərqli hüceyrə tipinə çevrilmə və ya daimi müalicə davamlılığı yarana bilər.

Bu proseslərin bir hissəsi DNA-nın qablaşdırılma formasını müəyyən edən xromatin quruluşundakı dəyişikliklərlə, bir hissəsi isə zülal kodlaşdırmayan RNA-ların yaratdığı tənzimləyici şəbəkələrlə bağlıdır. Şişi əhatə edən immun hüceyrələri, damarlar və birləşdirici toxuma da hüceyrələrin hansı vəziyyətə keçəcəyinə təsir göstərir. Buna görə müalicəyə davamlılığı anlamaq üçün yalnız mutasiya siyahısına baxmaq kifayət etmir; hüceyrənin hansı proqramla işlədiyini, zaman ərzində necə dəyişdiyini və ətrafı ilə necə "danışdığını" da görmək lazımdır (yeni nəsil sekvenləşdirmə, CRISPR ilə davamlılıq mexanizmlərinin kəşfi).

Xüsusi say hansı mövzuları əhatə edir?

Xüsusi say xərçəng hüceyrəsinin plastikliyini idarə edən genomik və epigenomik mexanizmləri, onların müalicəyə cavaba və residivə təsirini həm solid şişlərdə, həm də qan xərçənglərində nəzərdən keçirir. Əhatə olunan əsas mövzular bunlardır:

• Xromatinin yenidən qurulması: DNA-nın qablaşdırılma formasındakı dəyişikliklərin hüceyrə kimliyinə təsiri.
• Transkripsiya və kodlaşdırmayan RNA şəbəkələri: Hansı genlərin nə vaxt açılıb-bağlanacağını müəyyən edən tənzimləyici sistemlər (RNA sekvenləşdirmə və transkriptom).
• Klonal təkamül: Müalicə təzyiqi altında hansı hüceyrə qruplarının seçilib çoxaldığı.
• Şişin mikromühitlə qarşılıqlı əlaqəsi: İmmun hüceyrələrinin, birləşdirici toxumanın və damarların hüceyrə plastikliyinə töhfəsi.
• Virusla əlaqəli xərçənglər: Məsələn, HPV ilə əlaqəli xərçənglərdə plastiklik və davamlılıq (HPV və baş-boyun xərçəngləri).
• Mitoxondri ilə nüvə arasındakı əlaqə: Hüceyrənin enerji mərkəzinin davamlılıqda və kimlik dəyişməsində rolu.

Hansı metodlar ön plana çıxır?

Xüsusi say plastikliyi zaman ərzində və toxumadakı yerinə görə görməyə imkan verən metodlarla aparılmış işləri xüsusilə dəvət edir: hər hüceyrəni ayrıca araşdıran tək hüceyrə analizləri, hüceyrələrin toxumadakı mövqeyini qoruyaraq gen ifadəsini ölçən məkan metodları, hüceyrələrin şəcərəsini çıxaran nəsil izləmə texnikaları, hansı genin həqiqətən zəruri olduğunu yoxlayan CRISPR skrininqləri və xəstənin şişindən laboratoriyada yetişdirilən orqanoidlər. Bu metodların ümumi məqsədi şişi bir anlıq fotoşəkil kimi deyil, müalicə ilə birlikdə dəyişən bir film kimi izləməkdir (tək hüceyrə atlası nümunəsi, Türkiyədən bir transkriptom atlası, CRISPR nədir?).

Redaktorlar olaraq xüsusi önəm verdiyimiz bir məqam var: səbəb-nəticə əlaqəsini sadə birgə rastgəlmədən ayıra bilən, müalicə baxımından hədəflənə bilən zəif nöqtələri ortaya qoyan və ya uyğunlaşan hüceyrə vəziyyətlərini göstərən markerləri təsdiqləyən işlər prioritet olacaq. Məqsədimiz əsas genetik mexanizmlərlə klinik onkologiya arasında körpü qurmaq və davamlılığı yaranmazdan əvvəl proqnozlaşdırıb aradan qaldırmağa yönəlmiş strategiyalara töhfə verməkdir (mutasiyaların funksional mənası, genetik test hesabatlarında davamlılıq).

Tədqiqatçılar necə töhfə verə bilər?

Xüsusi saya orijinal tədqiqat məqalələri, icmallar və qısa məqalələr göndərilə bilər. Məqalələr MDPI-ın onlayn sistemində qeydiyyatdan keçməklə və xüsusi say seçilməklə yüklənir. Planlaşdırılan məqalə üçün başlıq və təxminən 250 sözlük xülasə uyğunluğun ilkin qiymətləndirilməsi məqsədilə əvvəlcədən jurnalın redaksiyasına göndərilə bilər. İlkin yoxlamadan keçən bütün məqalələr birtərəfli kor resenziyadan keçir; qəbul edilən məqalələr gözləmədən dərc olunur və xüsusi say səhifəsində birlikdə siyahıya alınır.

Genes MDPI tərəfindən nəşr olunan beynəlxalq, resenziyalı və açıq girişli aylıq jurnaldır. Açıq giriş sayəsində dərc olunan məqalələri dünyanın hər yerindən pulsuz oxumaq mümkündür; bunun müqabilində müəlliflərdən məqalə emalı haqqı (2600 İsveçrə frankı) alınır. Yazı qaydaları və digər təfərrüatlar jurnalın müəlliflər üçün məlumat səhifəsində yer alır.

Bu, xəstələr üçün nə deməkdir?

Elmi jurnalın xüsusi sayı birbaşa yeni müalicə demək deyil. Lakin müalicəyə davamlılıq xərçəng xəstələrinin və həkimlərin üzləşdiyi ən çətin problemlərdən biridir. Davamlılığın necə inkişaf etdiyini daha yaxşı anlamaq hansı xəstədə davamlılığın erkən yaranacağını əvvəlcədən proqnozlaşdırmağa, dərmanların hansı ardıcıllıqla və ya hansı kombinasiyalarda veriləcəyinə qərar verməyə və davamlılıq yarandıqda hansı yeni hədəflərin sınaqdan keçirilə biləcəyini müəyyənləşdirməyə kömək edə bilər. Bu gün bəzi xərçəng növlərində davamlılıq yarandıqda təkrar biopsiya və ya qan testi ilə yeni genetik dəyişikliklərin axtarılması belə tədqiqatların klinik praktikaya yansımış nümunələridir (qabaqcıl genomik testlər, sekvenləşdirmə texnologiyaları, kastrasiyaya davamlı prostat xərçəngi).

Xüsusi sayda yer alacaq işlərin əhəmiyyətli hissəsi laboratoriya və heyvan modelləri və ya xəstə nümunələri üzərində aparılan fundamental tədqiqatlar olacaq. Bu tapıntıların müalicəyə çevrilməsi üçün onlar klinik tədqiqatlarda sınaqdan keçirilməlidir. Bu prosesdə xəstələrin klinik tədqiqatlarda iştirakı və elmi araşdırmalar üçün toxuma nümunəsi bağışlaması da mühüm rol oynayır (klinik tədqiqat nədir?, laboratoriyadan klinikaya davamlılıq tədqiqatları).

Tez-tez verilən suallar

Elmi jurnallarda xüsusi say nədir?

Xüsusi say jurnalın müəyyən bir mövzuya həsr olunmuş məqalələri qonaq redaktorların rəhbərliyi ilə bir araya gətirdiyi toplusudur. Məqalələr jurnalın adi resenziya prosesindən keçir, qəbul edildikcə dərc olunur və xüsusi say səhifəsində birlikdə siyahıya alınır.

Bu xüsusi sayın mövzusu nədir?

Xərçəng hüceyrələrinin müalicə təzyiqi altında gen ifadəsi proqramlarını və kimliklərini dəyişərək dərmanlara qarşı necə davamlılıq qazandığı; bu prosesdə genetik dəyişikliklərin, epigenetik yenidən proqramlaşdırmanın, kodlaşdırmayan RNA-ların və şiş mikromühitinin rolu.

Kimlər məqalə göndərə bilər və son tarix nə vaxtdır?

Mövzu ilə bağlı orijinal tədqiqatı, icmalı və ya qısa məqaləsi olan bütün tədqiqatçılar MDPI sistemi vasitəsilə məqalə göndərə bilər. Son tarix 5 avqust 2027-ci ildir. Məqalə emalı haqqı 2600 İsveçrə frankıdır.

Bu xüsusi say xəstələr üçün nə deməkdir?

O, birbaşa yeni müalicə təqdim etmir; lakin müalicəyə davamlılığın necə inkişaf etdiyini anlamağa yönəlmiş bilik bazasına töhfə verir. Bu biliklər gələcəkdə davamlılığı əvvəlcədən proqnozlaşdırmağa və aradan qaldırmağa yönəlmiş müalicə strategiyalarının hazırlanmasına kömək edə bilər.

Lüğət

Hüceyrə plastikliyi

Xərçəng hüceyrəsinin gen ifadəsi proqramını və kimliyini dəyişə bilmə qabiliyyəti.

Müalicəyə davamlılıq

Xərçəngin başlanğıcda təsirli olan dərmana baxmayaraq böyüməyə davam etməsi və ya yenidən böyüməsi.

Dərmana dözümlü "persister" hüceyrə

Dərman təzyiqi altında müvəqqəti olaraq sağ qalan, dərman dayandırıldıqda yenidən həssas vəziyyətə qayıda bilən hüceyrə.

Hüceyrə xəttinin dəyişməsi

Şiş hüceyrələrinin müalicə zamanı fərqli hüceyrə tipinə çevrilməsi; məsələn, ağciyər adenokarsinomasının xırda hüceyrəli xərçəngə çevrilməsi.

Epigenetika

DNA ardıcıllığını dəyişmədən genlərin açılıb-bağlanmasını tənzimləyən mexanizmlər.

Xromatin

DNA-nın zülallarla birlikdə qablaşdırılmış forması; qablaşdırılma forması genlərin oxuna bilməsini müəyyən edir.

Kodlaşdırmayan RNA

Zülal sintez etməyən, lakin gen ifadəsini tənzimləyən RNA molekulları.

Tək hüceyrə analizi

Şişdəki hər hüceyrənin gen ifadəsinin ayrıca ölçülməsi.

Məkan transkriptomikası

Gen ifadəsinin hüceyrələrin toxumadakı mövqeyi qorunmaqla ölçülməsi.

Orqanoid

Xəstənin şiş toxumasından laboratoriyada üçölçülü şəkildə yetişdirilən kiçik toxuma modeli.