Новый онлайн-инструмент оценки наследственного риска рака — кому нужны генетические тесты?

Хотя все опухоли возникают вследствие генетических повреждений, примерно в 10-15% случаев они передаются от родителей. Такие опухоли называют наследственным раком. Проект «Геном человека», завершенный в 2003 году, и последовавший за ним Атлас ракового генома, завершенный в 2020 году, помогли лучше понять распространенность и значение наследственного рака. Однако выявление наследственных опухолей и людей из группы риска по-прежнему имеет большие пробелы.

Если клинические данные, например ранний возраст рака и семейный анамнез, вызывают подозрение на наследственную форму, ее следует подтвердить генетическим тестированием. Другой важный вопрос — кому именно его следует проходить. Для решения этой задачи разрабатывают системы поддержки клинических решений. В статье рассматривается созданный для этой цели онлайн-инструмент.

Система поддержки решений при наследственном раке

Новый онлайн-инструмент способен быстро и точно выявлять людей с высокой вероятностью наличия мутаций в генах наследственного рака и тем самым определять, кому принесет пользу генетическое тестирование.

PREMMplus — онлайн-инструмент, разработанный и проверенный исследователями Dana-Farber Cancer Institute на данных более 30 тысяч человек, прошедших многогенное тестирование наследственного риска рака. Последняя научная работа о PREMMplus опубликована 15 августа 2022 года в Journal of Clinical Oncology.

Как отметила представитель Dana-Farber доктор Sapna Syngal, «Наши результаты показывают, что PREMMplus способен изменить подход к направлению пациентов и родственников на генетическое тестирование и консультирование».

Традиционно человека с семейной историей рака, обеспокоенного этим, направляют в генетическую клинику, где консультант собирает подробный анамнез. Однако центров онкогенетического консультирования недостаточно во всем мире.

«В условиях нехватки генетических консультантов PREMMplus может модернизировать оценку риска, помогая людям понимать результаты тестов и варианты действий при выявлении гена предрасположенности к раку и позволяя сосредоточить время там, где помощь нужнее всего», — говорит Syngal.

Как это работает?

Инструмент использует клинические сведения — возраст, пол, этническую принадлежность, личный и семейный анамнез 18 видов рака — для определения вероятности потенциального генетического изменения (ПГИ) в 19 генах предрасположенности к раку.

При выявлении носителей ПГИ в 11 хорошо изученных высокопенетрантных генах риска категории A оценка PREMMplus 2,5% и выше имеет чувствительность 89% – 94% и отрицательную прогностическую ценность более 97%. К тесно связанным с наследственным раком генам относятся APC, BRCA1, BRCA2, CDH1, EPCAM, MLH1, MSH2, MSH6, MUTYH, PMS2 и TP53.

Команда отмечает, что эти ПГИ «представляют различные наследственные риски рака». Знание о варианте, повышающем наследственный риск, помогает предотвратить рак или выявить его очень рано, если человек еще не болен. При уже имеющемся раке пациенту могут подойти новые препараты, направленные на такие наследственные изменения.  

С этими ПГИ связаны опухоли синдрома Линча, а также рак молочной железы, яичников, толстой кишки, поджелудочной железы и простаты. По данным команды, способность PREMMplus выявлять носителей ПГИ в генах умеренного риска, например CHEK2 и ATM, несколько ниже, но все же «достаточно высока»: чувствительность 84% – 90% и отрицательная прогностическая ценность более 93%.

Syngal сообщила, что ее конечная цель — интеграция инструмента в электронные медицинские карты (ЭМК). «Через ЭМК его можно было бы предлагать людям на приеме у онколога или семейного врача либо перед маммографией или колоноскопией. Тогда врач или медсестра заранее получат сведения и при необходимости направят человека на генетическое тестирование».

Сейчас инструмент не подходит для повседневного клинического применения. Однако цель — сделать его доступным онлайн в течение нескольких месяцев.

По словам Syngal, будут доступны две версии:

1. Понятная пользователю версия, которую пациенты заполняют самостоятельно, сообщит, превышен ли порог необходимости тестирования. С этой информацией пациент затем обратится к семейному врачу.
2. В другой версии врач и пациент заполнят сведения вместе на очном приеме. PREMMplus будет бесплатным для отдельных пациентов и медицинского персонала.

«Мы надеемся, что инструмент будут использовать больничные системы, а также страховщики, чтобы видеть, кому нужен тест, и решать, кому согласовать его проведение».