Что за новый вариант-мутация коронавируса? Как его открыли? Будут ли вакцины эффективны?
В этой статье
Британский генетический консорциум Covid-19 с апреля 2020 года изучал 140 тысяч SARS-CoV-2 геномов вируса посредством секвенирования, анализируя генетические изменения. 18 декабря 2020 года консорциум сообщил об открытии нового варианта — генетически и поведенчески новой разновидности вируса. Этот вариант SARS-CoV-2 назвали «VUI-202012/01» или «B.1.1.7». Ответим на вопросы в свете имеющихся научных данных.
Что такое новый SARS-CoV-2? Что мы знаем?
Новый британский вариант назвали «VUI-202012/01» или «B.1.1.7». Его значимость в отличие от прежних вариантов — большое количество мутаций (генетических изменений).
B.1.1.7 имеет 17 мутаций в разных участках вируса.
Новые описанные мутации коронавируса:
- В ORF1ab: T1001I, A1708D, I2230T, SGF 3675-3677 (делеция / удаление)
- В Spike (шипе): делеция 69-70, делеция Y144, N501Y, A570D, P681H, T716I, S982A и D1118H
- В N: Q27stop, R52I и Y73C in ÖRF8; D3L и S235F
Среди этих мутаций наиболее важны те, которые в спайк-белках возникли: N501Y, N439K, Y453F и 69-70del.
Почему новый вариант заразнее?
N501Y возникла в рецепторсвязывающей области спайк-белка. Этот участок вирус использует для связывания с человеческим рецептором ACE2 . Мутация может усиливать связывание с ACE2.
Другие две мутации N439K и Y453 также возникли в рецепторсвязывающей области. Показано усиление связывания вируса с ACE2 и иммунной системы облегчение уклонения от неё .
P681H возникла в точке расщепления спайк-белка фурином. Биологический эффект пока неизвестен.
Делеция 69-70 — удаление аминокислот 69 и 70 спайк-белка. Предполагается облегчение уклонения от иммунитета. Возможно, она возникла у хронического пациента Covid-19 на конвалесцентной плазме. Вирус мог измениться, чтобы избежать антительного лечения.
Лабораторно ранее показано, что мутации облегчают заражение клеток и мышей. Но прямых научных доказательств большей заразности у людей пока нет.
Когда открыли вариант?
Все вирусы со временем мутируют и создают новые варианты. Это ожидаемо.
Генетический анализ показал появление нового SARS-CoV-2 в сентябре 2020и низкую частоту в обществе до середины ноября.
Открытие связано с расследованием британского центра общественного здоровья, почему случаи в Кенте не снижались при строгих мерах.
Затем выявлено быстрое распространение в Лондоне и Эссексе. В других странах подробный геномный анализ не проводился, и распространённость неизвестна. Но в Италии новый вариант выявили у прибывшего из Великобритании.
Будут ли вакцины эффективны против нового коронавируса?
Научных доказательств пока нет. Влияние варианта на вакцины определят лабораторные исследования.
Разработанные 3 современные вакцины (BioNTech, Moderna и AstraZeneca) нацелены на спайк-белки. Новый вариант имеет мутации в этой области. Вакцины вызывают антитела против нескольких участков спайка, поэтому снижение эффективности новым вариантом весьма маловероятно. Иммунитет обеспечивается множественными антителами.
Ожидаемы ли мутации SARS-CoV-2?
SARS- CoV-2 — RNA вирус. Мутации при размножении естественны. С начала эпидемии в SARS-CoV-2 обнаружены тысячи мутаций. Большинство ничего не меняет. Например, в спайке SARS-CoV-2 уже выявлено более 4000 мутаций.
Карантин и запреты полётов стран вполне нормальны. Эти меры нужны, пока свойства нового варианта не поняты.
*
*
СВЯЗАННЫЕ ТЕМЫ
Источники
2. COVID-19 Genomics UK (COG-UK) [email protected]. 2020. An Integrated National Scale SARS-CoV-2 Genomic Surveillance Network. The Lancet. Microbe 1 (3): e99–100. Bal A, Destras G, Gaymard A, Regue H, Semanas Q, d’Aubarde C, Billaud G, Laurent F, Gonzales C, Valette
3. M, Lina B, Morfin F, Josset L. Screening of the H69 and V70 deletions in the SARS-CoV-2 spike protein with a RT-PCR diagnosis assay reveals low prevalence in Lyon, France. medRxiv 2020, 2020.11.10.20228528.
4. Kemp, Steven A., Dami A. Collier, Rawlings Datir, Salma Gayed, Aminu Jahun, Myra Hosmillo, Isabella Atm Ferreira, et al. 2020. Neutralising Antibodies Drive Spike Mediated SARS-CoV-2 Evasion. medRxiv.
5. Andrew Rambaut, Edward C. Holmes, Áine O’Toole, Verity Hill, John T. McCrone, Christopher Ruis, Louis du Plessis, and Oliver G. Pybus. 2020. A Dynamic Nomenclature Proposal for SARS-CoV-2 Lineages to Assist. Genomic Epidemiology. Nature Microbiology 5 (11): 1403–7.
6. Thomson EC, Rosen LE, Shepherd JG, Spreafico R. 2020. The Circulating SARS-CoV-2 Spike Varyant N439K Maintains Fitness While Evading Antibody-Mediated Immunity. bioRxiv.
7. Erik Volz, Verity Hill, John T. McCrone, Anna Price, David Jorgensen, Áine O’Toole, Joel Southgate, et al. 2020. “Evaluating the Effects of SARS-CoV-2 Spike Mutation D614G on Transmissibility and Pathogenicity.” Cell, November.
8. NERVTAG: Risk assessment of SARS-CoV-2 varyants that have been selected in mink, 12 November 2020. Paper prepared by the New and Emerging Respiratory Virus Threats Advisory Group (NERVTAG).
9. Preliminary genomic characterisation of an emergent SARS-CoV-2 lineage in the UK defined by a novel set of spike mutations, Andrew Rambaut, Nick Loman, Oliver Pybus, Wendy Barclay, Jeff Barrett, Alesandro Carabelli, Tom Connor, Tom Peacock, David L Robertson, Erik Volz, on behalf of COVID-19 Genomics Consortium UK (COG-UK). https://virological.org/t/563
Эта статья была полезна?
Ваш отзыв помогает нам улучшать материалы.
Комментарии читателей
Оставьте комментарий
Ваше имя и комментарий публикуются только после одобрения администратором. Ваш адрес электронной почты никогда не показывается посетителям.
Будьте первым, кто оставит комментарий.